墨尔本当地时间1月12日，2006年澳网组委会公布了男女单打的种子名单，费德勒和达文波特分别被列为男女头号种子。
由于排名的下滑，卫冕冠军小威廉姆斯仅仅排在第13号种子，她的姐姐维纳斯是女单10号种子。
随着纳达尔的退出，世界第三位的罗迪克成为了赛会2号种子，上届亚军休伊特是男单3号种子。被列为4号种子的是去年大师杯决赛击败费德勒夺冠的纳尔班迪安。
女子方面，分列2-4位的种子球员分别是克里斯特尔斯、毛瑞斯莫和萨拉波娃，其中俄罗斯人占据了女单种子的9个名额。
以下是本届澳网的单打种子名单：
男子单打：
1，费德勒（瑞士）
2，罗迪克（美国）
3，休伊特（澳大利亚）
4，纳尔班迪安（阿根廷）
5，达维登科（俄罗斯）
6，科里亚（阿根廷）
7，柳比西奇（克罗地亚）
8，高迪奥（阿根廷）
9，冈萨雷斯（智利）
10，托马斯·约翰森（瑞典）
11，费雷尔（西班牙）
12，赫巴蒂（斯洛伐克）
13，吉内普里（美国）
14，加斯奎特（法国）
15，费雷罗（西班牙）
16，罗布雷多（西班牙）
17，斯特潘内克（捷克）
18，安西奇（克罗地亚）
19，伯蒂奇（捷克）
20，布莱克（美国）
21，基弗（德国）
22，孟菲尔斯（法国）
23，安德列夫（俄罗斯）
24，奥利维耶·罗查斯（比利时）
25，格罗斯让（法国）
26，涅米宁（芬兰）
27，顿特（美国）
28，沃达斯科（西班牙）
29，沃兰德里（意大利）
30，米尔尼（白俄罗斯）
31，洛佩兹（西班牙）
32，莫亚（西班牙）
女子单打：
1，达文波特（美国）
2，克里斯特尔斯（比利时）
3，毛瑞斯莫（法国）
4，萨拉波娃（俄罗斯）
5，皮尔斯（法国）
6，佩特洛娃（俄罗斯）
7，施奈德（瑞士）
8，海宁（比利时）
9，德门蒂耶娃（俄罗斯）
10，维纳斯·威廉姆斯（美国）
11，德西（法国）
12，米斯金娜（俄罗斯）
13，塞琳娜·威廉姆斯（美国）
14，库兹涅索娃（俄罗斯）
15，斯奇沃内（意大利）
16，瓦迪索娃（捷克）
17，汉图楚娃（斯洛伐克）
18，利霍夫采娃（俄罗斯）
19，萨芬娜（俄罗斯）
20，佩内塔（意大利）
21，伊万诺维奇（塞黑）
22，格罗内费尔德（德国）
23，扬科维奇（塞黑）
24，格鲁温（法国）
25，基里连科（俄罗斯）
26，杉山爱（日本）
27，巴托丽（法国）
28，加里格斯（西班牙）
29，库卡洛娃（捷克）
30，兹沃娜列娃（俄罗斯）
31，杜尔科（阿根廷）
32，米尔扎（印度）
